Церковь Святого Иоанна Предтечи строилась на Корфу в трудные для православия времена, когда островом владели венецианцы-католики – в последней четверти XV века (в 1480 году).
Церковь находится на площади Святая Плакада вместе с двумя другими церквями – церковью Пресвятой Богородицы и церковью Св. Спиридона. Найти ее будет достаточно просто – ориентируйтесь на красную маковку колокольни Церковь Святого Спиридона, которую отлично видно из любой точки Старый город Корфу.
Во второй половине XVIII века здесь служил известнейший религиозный деятель Никифор Феотоки, позднее переехавший в Россию и служивший архиепископом Ставрополья и Астрахани.
Адмирал Ушаков часто посещал литургию в этом храме. Адмирал вообще много сделал как для освобождения острова от французов, так и для восстановления православных церквей Корфу и их статуса. За что ему и был установлен Мемориал адмирала Ушакова.
Как и большинство церквей острова Корфу, церковь Святого Иоанна Предтечи построена в виде прямоугольной византийской базилики. Согласно древней архитектурной традиции церковь Святого Иоанна Предтечи поделена на две части. Первая из них расположена недалеко от входа и отделена стеной от центральной части храма. Сюда допускают всех желающих, включая иноверцев и некрещеных. В этой части хранится несколько облачений архиепископа Н. Феотоки, а также две очень старые фрески и икона
Храм построен в виде четырехугольной византийской базилики, как и большинство храмов Корфу. Храм по старинной корфиотской традиции разделен на два помещения – помещение при входе отделено от центральной части храма стеной. В первое помещение разрешалось заходить некрещеным. Там же сейчас находятся несколько облачений Никифора Феотоки, две старинные фрески и икона почитаемого в Греции Святого отрока Фанурия.
В церкви Святого Иоанна Предтечи хранятся частички мощей Святого Иоанна Дамаскина и Святого Арсения.